Керівництво роботою Великовікнинської загальноосвітньої школи І-ІІІ ступенів здійснюють директор, його заступники з навчально-виховної роботи, помічник директора з господарської частини, їхні права та обов'язки визначені Положенням про середній загальноосвітній навчально-виховний заклад.

• Директор школи – Барчук Юрій Артемович, вчитель креслення і трудового навчання, спеціаліст вищої категорії, організовує навчально-виховний процес, здійснює контроль за його ходом і результатами, відповідає за якість і ефективність роботи педагогічного колективу, за дотримання вимог охорони дитинства і праці, створює необхідні умови для участі учнів у позакласній та позашкільній роботі.
• Заступник директора по навчально-виховній роботі – Петрашкевич Ольга Іванівна, вчитель фізики і інформатики, спеціаліст другої категорії, організовує та контролює процес навчання школярів, їх загальноосвітню і трудову підготовку, всебічний розвиток і поведінку; перевіряє виконання навчальних планів і програм, якість знань, умінь і навичок учнів; здійснює керівництво методичною роботою з учителями школи.
• Заступник директора по навчально-виховній роботі – Поліщук Марія Іванівна, вчитель біології, спеціаліст першої категорії, організовує позакласну виховну роботу і дозвілля учнів школи, надає необхідну допомогу класним керівникам, вихователям та іншим працівникам школи, що залучаються до проведення виховної роботи з учнями, підтримує зв'язки з позашкільними установами, громадськими організаціями і державними органами, причетними до виховання молоді.
• Помічник директора з господарської частини – Дубовий Андрій Дмитрович, відповідає за збереження шкільних будов і майна, матеріальне забезпечення навчального процесу, санітарний стан школи, протипожежну безпеку, правильну організацію роботи обслуговуючого персоналу.

     У роботі керівництва Великовікнинської загальноосвітньої школи І-ІІІ ступенів забезпечується контроль за виконанням навчальних планів і програм, якістю знань учнів, дотримуються вимоги щодо охорони дитинства, підтримуються ініціативи стосовно вдосконалення системи навчання та виховання, заохочуються творчі пошуки педагогів, реалізуються права учнів на захист від будь-яких форм фізичного або психічного насильства.